Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms