Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFC1P35251 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFC1P35251 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFC1P35251 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFC1P35251 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RFC1P35251 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFC1P35251 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFC1P35251 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFC1P35251 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFC1P35251 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFC1P35251 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFC1P35251 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFC1P35251 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFC1P35251 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFC1P35251 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFC1P35251 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFC1P35251 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFC1P35251 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFC1P35251 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFC1P35251 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFC1P35251 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFC1P35251 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFC1P35251 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFC1P35251 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFC1P35251 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFC1P35251 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFC1P35251 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFC1P35251 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFC1P35251 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFC1P35251 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFC1P35251 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFC1P35251 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFC1P35251 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFC1P35251 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFC1P35251 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFC1P35251 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFC1P35251 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFC1P35251 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFC1P35251 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFC1P35251 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFC1P35251 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFC1P35251 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFC1P35251 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RFC1P35251 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFC1P35251 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFC1P35251 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFC1P35251 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFC1P35251 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RFC1P35251 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RFC1P35251 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFC1P35251 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFC1P35251 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFC1P35251 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFC1P35251 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFC1P35251 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFC1P35251 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms