Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTX2P32243 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTX2P32243 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTX2P32243 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTX2P32243 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTX2P32243 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OTX2P32243 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTX2P32243 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTX2P32243 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTX2P32243 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTX2P32243 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTX2P32243 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTX2P32243 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTX2P32243 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTX2P32243 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTX2P32243 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTX2P32243 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTX2P32243 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTX2P32243 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTX2P32243 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTX2P32243 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTX2P32243 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTX2P32243 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
OTX2P32243 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
OTX2P32243 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTX2P32243 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTX2P32243 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTX2P32243 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTX2P32243 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTX2P32243 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
OTX2P32243 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTX2P32243 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTX2P32243 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTX2P32243 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTX2P32243 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTX2P32243 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OTX2P32243 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTX2P32243 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTX2P32243 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTX2P32243 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OTX2P32243 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTX2P32243 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTX2P32243 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OTX2P32243 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTX2P32243 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTX2P32243 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTX2P32243 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTX2P32243 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTX2P32243 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTX2P32243 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OTX2P32243 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTX2P32243 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTX2P32243 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTX2P32243 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTX2P32243 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTX2P32243 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms