Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFNP31947 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFNP31947 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFNP31947 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFNP31947 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFNP31947 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFNP31947 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFNP31947 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFNP31947 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFNP31947 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFNP31947 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SFNP31947 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFNP31947 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFNP31947 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFNP31947 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFNP31947 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFNP31947 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFNP31947 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFNP31947 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SFNP31947 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SFNP31947 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SFNP31947 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFNP31947 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFNP31947 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFNP31947 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFNP31947 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFNP31947 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFNP31947 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFNP31947 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFNP31947 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFNP31947 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFNP31947 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFNP31947 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFNP31947 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFNP31947 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFNP31947 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFNP31947 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms