Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
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