Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms