Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms