Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA2P26232 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA2P26232 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms