Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRKCHP24723 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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