Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5F1P24539 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5F1P24539 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms