Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms