Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms