Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms