Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR1P18146 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR1P18146 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms