Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT3P12035 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT3P12035 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT3P12035 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT3P12035 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT3P12035 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT3P12035 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT3P12035 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT3P12035 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT3P12035 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT3P12035 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT3P12035 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT3P12035 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT3P12035 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT3P12035 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT3P12035 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT3P12035 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT3P12035 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT3P12035 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT3P12035 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT3P12035 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT3P12035 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT3P12035 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT3P12035 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT3P12035 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT3P12035 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT3P12035 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT3P12035 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT3P12035 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT3P12035 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT3P12035 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT3P12035 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT3P12035 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT3P12035 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT3P12035 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT3P12035 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT3P12035 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT3P12035 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT3P12035 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT3P12035 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT3P12035 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT3P12035 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT3P12035 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT3P12035 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT3P12035 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT3P12035 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT3P12035 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT3P12035 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT3P12035 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT3P12035 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT3P12035 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT3P12035 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT3P12035 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms