Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF1P10914 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF1P10914 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF1P10914 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF1P10914 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF1P10914 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF1P10914 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF1P10914 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF1P10914 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF1P10914 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF1P10914 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF1P10914 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF1P10914 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF1P10914 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF1P10914 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF1P10914 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF1P10914 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF1P10914 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF1P10914 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms