Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHGAP10645 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHGAP10645 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHGAP10645 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHGAP10645 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHGAP10645 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHGAP10645 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHGAP10645 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHGAP10645 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHGAP10645 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHGAP10645 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHGAP10645 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHGAP10645 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CHGAP10645 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHGAP10645 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHGAP10645 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHGAP10645 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHGAP10645 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHGAP10645 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHGAP10645 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHGAP10645 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHGAP10645 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHGAP10645 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHGAP10645 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHGAP10645 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHGAP10645 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHGAP10645 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHGAP10645 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHGAP10645 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHGAP10645 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHGAP10645 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHGAP10645 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHGAP10645 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHGAP10645 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHGAP10645 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHGAP10645 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHGAP10645 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CHGAP10645 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHGAP10645 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHGAP10645 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CHGAP10645 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHGAP10645 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHGAP10645 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHGAP10645 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHGAP10645 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHGAP10645 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHGAP10645 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CHGAP10645 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHGAP10645 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHGAP10645 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHGAP10645 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHGAP10645 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHGAP10645 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHGAP10645 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHGAP10645 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHGAP10645 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHGAP10645 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHGAP10645 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHGAP10645 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHGAP10645 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHGAP10645 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHGAP10645 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHGAP10645 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHGAP10645 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHGAP10645 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHGAP10645 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHGAP10645 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHGAP10645 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHGAP10645 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHGAP10645 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHGAP10645 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CHGAP10645 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHGAP10645 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHGAP10645 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHGAP10645 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CHGAP10645 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CHGAP10645 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CHGAP10645 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHGAP10645 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHGAP10645 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CHGAP10645 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHGAP10645 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHGAP10645 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHGAP10645 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHGAP10645 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHGAP10645 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHGAP10645 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHGAP10645 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHGAP10645 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHGAP10645 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHGAP10645 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHGAP10645 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHGAP10645 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHGAP10645 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHGAP10645 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHGAP10645 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHGAP10645 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHGAP10645 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHGAP10645 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHGAP10645 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms