Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM225BP0DP42 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms