Protein–RNA interactions for Protein: P0CG23

ZNF853, Zinc finger protein 853, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF853P0CG23 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF853P0CG23 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF853P0CG23 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF853P0CG23 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF853P0CG23 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms