Protein–RNA interactions for Protein: P0C879

Putative uncharacterized protein FLJ43185, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C879 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0C879 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0C879 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P0C879 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
P0C879 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P0C879 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P0C879 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms