Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPSAP08865 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPSAP08865 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPSAP08865 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPSAP08865 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPSAP08865 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPSAP08865 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPSAP08865 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPSAP08865 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPSAP08865 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPSAP08865 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPSAP08865 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPSAP08865 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPSAP08865 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPSAP08865 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPSAP08865 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPSAP08865 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPSAP08865 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPSAP08865 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPSAP08865 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPSAP08865 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RPSAP08865 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RPSAP08865 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms