Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
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