Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX58O95786 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX58O95786 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX58O95786 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX58O95786 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX58O95786 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX58O95786 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX58O95786 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX58O95786 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX58O95786 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX58O95786 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX58O95786 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX58O95786 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX58O95786 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX58O95786 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX58O95786 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX58O95786 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX58O95786 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX58O95786 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX58O95786 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX58O95786 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX58O95786 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX58O95786 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX58O95786 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX58O95786 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX58O95786 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX58O95786 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX58O95786 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX58O95786 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX58O95786 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX58O95786 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX58O95786 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX58O95786 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX58O95786 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX58O95786 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX58O95786 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX58O95786 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX58O95786 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX58O95786 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX58O95786 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX58O95786 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX58O95786 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDX58O95786 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDX58O95786 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDX58O95786 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
DDX58O95786 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX58O95786 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX58O95786 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX58O95786 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX58O95786 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX58O95786 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX58O95786 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX58O95786 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX58O95786 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX58O95786 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX58O95786 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms