Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms