Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms