Protein–RNA interactions for Protein: O75446

SAP30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30O75446 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAP30O75446 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAP30O75446 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAP30O75446 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAP30O75446 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAP30O75446 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAP30O75446 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAP30O75446 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAP30O75446 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAP30O75446 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAP30O75446 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAP30O75446 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms