Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TIMM17BO60830 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms