Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSCO60682 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MSCO60682 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSCO60682 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSCO60682 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSCO60682 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSCO60682 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSCO60682 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSCO60682 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSCO60682 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSCO60682 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSCO60682 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MSCO60682 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MSCO60682 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSCO60682 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSCO60682 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSCO60682 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSCO60682 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSCO60682 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MSCO60682 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MSCO60682 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MSCO60682 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MSCO60682 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MSCO60682 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSCO60682 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSCO60682 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSCO60682 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSCO60682 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MSCO60682 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MSCO60682 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSCO60682 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSCO60682 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSCO60682 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSCO60682 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSCO60682 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSCO60682 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSCO60682 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSCO60682 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSCO60682 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSCO60682 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSCO60682 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MSCO60682 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSCO60682 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSCO60682 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms