Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE8AO60658 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms