Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms