Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms