Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLOCKO15516 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms