Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ARPC5O15511 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms