Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
POLR3AO14802 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3AO14802 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms