Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APAF1O14727 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APAF1O14727 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APAF1O14727 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APAF1O14727 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APAF1O14727 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APAF1O14727 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APAF1O14727 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APAF1O14727 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APAF1O14727 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APAF1O14727 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APAF1O14727 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APAF1O14727 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APAF1O14727 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APAF1O14727 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APAF1O14727 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APAF1O14727 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APAF1O14727 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APAF1O14727 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APAF1O14727 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APAF1O14727 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APAF1O14727 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APAF1O14727 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APAF1O14727 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APAF1O14727 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APAF1O14727 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APAF1O14727 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APAF1O14727 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APAF1O14727 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APAF1O14727 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APAF1O14727 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APAF1O14727 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APAF1O14727 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APAF1O14727 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APAF1O14727 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APAF1O14727 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APAF1O14727 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APAF1O14727 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
APAF1O14727 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
APAF1O14727 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
APAF1O14727 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
APAF1O14727 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
APAF1O14727 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
APAF1O14727 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
APAF1O14727 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
APAF1O14727 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APAF1O14727 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APAF1O14727 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APAF1O14727 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APAF1O14727 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APAF1O14727 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APAF1O14727 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APAF1O14727 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APAF1O14727 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APAF1O14727 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APAF1O14727 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APAF1O14727 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APAF1O14727 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APAF1O14727 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APAF1O14727 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APAF1O14727 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APAF1O14727 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APAF1O14727 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APAF1O14727 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APAF1O14727 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APAF1O14727 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APAF1O14727 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APAF1O14727 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APAF1O14727 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APAF1O14727 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APAF1O14727 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APAF1O14727 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APAF1O14727 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APAF1O14727 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
APAF1O14727 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms