Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms