Protein–RNA interactions for Protein: O00750

PIK3C2B, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2BO00750 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2BO00750 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms