Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F3O00716 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F3O00716 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F3O00716 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F3O00716 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F3O00716 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F3O00716 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F3O00716 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F3O00716 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F3O00716 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F3O00716 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F3O00716 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F3O00716 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F3O00716 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F3O00716 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F3O00716 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F3O00716 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F3O00716 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F3O00716 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F3O00716 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms