Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CDO00329 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms