Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QW42 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QW42 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QW42 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QW42 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QW42 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QW42 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QW42 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QW42 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QW42 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QW42 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QW42 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QW42 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QW42 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QW42 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QW42 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QW42 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QW42 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QW42 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QW42 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QW42 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QW42 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QW42 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QW42 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QW42 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QW42 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QW42 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QW42 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QW42 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QW42 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QW42 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QW42 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QW42 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms