Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms