Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KR12 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KR12 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KR12 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KR12 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KR12 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KR12 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KR12 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KR12 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KR12 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KR12 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KR12 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KR12 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KR12 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KR12 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KR12 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KR12 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KR12 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KR12 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KR12 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KR12 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KR12 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
J3KR12 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
J3KR12 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
J3KR12 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
J3KR12 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
J3KR12 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
J3KR12 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
J3KR12 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
J3KR12 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
J3KR12 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
J3KR12 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
J3KR12 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
J3KR12 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KR12 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
J3KR12 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
J3KR12 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
J3KR12 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
J3KR12 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
J3KR12 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
J3KR12 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
J3KR12 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
J3KR12 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
J3KR12 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
J3KR12 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms