Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPA5E9PKD4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms