Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L11C9JVI0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms