Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN25C9JDP6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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