Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KRBOX1C9JBD0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRBOX1C9JBD0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms