Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms