Protein–RNA interactions for Protein: A6NM66

LINC01548, Uncharacterized protein encoded by LINC01548, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01548A6NM66 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01548A6NM66 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms