Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM200CA6NKL6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms