Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms